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    <message>La verdad es que Lichtman es un gran orador y sus charlas no te dejan indiferente. Sin embargo, en mi opini&#243;n se deja llevar bastante por sus bellas im&#225;genes (que provocan envidia instant&#225;nea a cualquiera que haga algo de 'imaging' en cualquier sistema) y deja de lado la utilidad de su m&#233;todo. Es cierto que, como &#233;l dice, est&#225; creando mapas del cerebro, y que cualquier mapa es util&#237;simo si sabes leerlo. Pero quiz&#225; en este momento las investigaciones neurol&#243;gicas podr&#237;an beneficiarse de experimentos mas mecan&#237;sticos y no tanto de los descriptivos. Con todo respeto a la Biolog&#237;a descriptiva, eh? Al fin y al cabo yo misma trabajo en eso :P</message>
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    <message>Hola Pere me encanta tu blog y lo sigo desde hace tiempo. Las imagenes obtenidas por el metodo brainbow son espectaculares y me gustaria saber si conoces donde puedo conseguirlas en un gran formato pq pienso decorar con ellas mi salon, Muchas gracias</message>
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    <message>Pienso que es un gran trabajo el que ha hecho Lichtman, aunque est&#225; claro que la biolog&#237;a para ser &#250;til no puede ser &#250;nicamente descriptiva, pero a mi entender esta es la base para futuras invesitagaciones mecan&#237;sticas.
de todas formas, la belleza de las im&#225;genes es impagable.

y por cierto, casi me da envidia el cerebro de C.elegans...yo lo cambiar&#237;a por el mio desbaratado XD</message>
    <name>Mar&#237;a</name>
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    <message>Hola a todos,

El Brainbow es impresionante, no comprendo por que la gente se obceca con las limitaciones en lugar de fijarse en las ventajas. si una nueva tecnica nos permite dar un paso hacia adelante, por pequenho que parezca, bienvenida sea.

Muy inspirador tu texto Pere.


Saludos,

Sergio</message>
    <name>Sergio</name>
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    <message>Brainbow....&#161;ingenioso nombre! Recuerda a la cromodin&#225;mica cu&#225;ntica para identificar los quarks, poni&#233;ndoles "color". Pero el color (otra met&#225;fora) no es un hecho f&#237;sico, sino una sensaci&#243;n ps&#237;quica personal, una realidad intraps&#237;quica. &#191;Es el mismo mi rojo que tu rojo? &#191;O mi rojo es tu azul? El color es una creaci&#243;n mental que ahora nos ayuda a crear la imagen de la mente. Valga como alegor&#237;a del Brainbow: Mapear es un primer paso, descriptivo, desde luego, espectacular. Pero me parece que las im&#225;genes son m&#225;s impresionantes que el fondo del asunto, pues no veo de qu&#233; manera se va a deducir la informaci&#243;n que trasnporta el cableado,
ni c&#243;mo se va a seguir el rastro de los pensamientos y sucesos mentales de extrema velocidad y complejidad. Veremos qu&#233; nos depara esta t&#233;cnica en los pr&#243;ximos a&#241;os. A&#250;n es pronto para echar las campanas al vuelo.
Enhorabuena por tu blog, Pere. </message>
    <name>I. Garc&#237;a-Vali&#241;o</name>
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    <message>Comparto mi opini&#243;n con algunos de los comentarios anteriores: el trabajo de Lichtman es bonito pero poco &#250;til para la neurociencia en este momento. Es cierto que poder visualizar todas las neuronas del cerebro independientemente podr&#237;a utilizarse para mapear  'el cableado' cerebral. Sin embargo, con esta t&#233;cnica ser&#237;a un trabajo de chinos (ninguna ofensa a los chinos). Vamos, que llevar&#237;a a&#241;os y a&#241;os. 

Si no hubiera otra alternativa pues ser&#237;a interesante. Pero s&#237; hay otra alternativa que realmente va a revolucionar la neurociencia. Se llama Neuroanatom&#237;a Computacional. Es un super projecto de colaboraci&#243;n entre el Instituto Max Planck en Alemania y aqu&#237; el MIT. Los alemanes han inventado un sistema microsc&#243;pico que corta rodajas de cerebro de pocas micras y saca fotograf&#237;as de forma autom&#225;tica. Los del MIT est&#225;n dise&#241;ando software para interpretar las im&#225;genes tomadas por el microscopio y hacer una reconstrucci&#243;n en 3D. 

El a&#241;o pasado asist&#237; a una conferencia en la que mostraban esta nueva tecnolog&#237;a y es incre&#237;ble. No he podido encontrar el video que se mostr&#243; (Pere a ver si tienes suerte, el del Max Planck es el famos&#237;simo Winfried Denk, que invent&#243; el microscopio de 2 fotones. El del MIT se llama Sebastian Seung). 
En mi opini&#243;n, est&#225; claro que para mapear el cerebro se necesita una t&#233;cnica como la Neuroanatom&#237;a Computacional.  

Saludos</message>
    <name>Vicky Puig</name>
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    <message>Mi cerebro es como el del gusano.</message>
    <name>Alejandro Pan y Vino</name>
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    <message>prometedora como poco
&#191;se podr&#237;a sececionar las proteinas expresadas o ag&#250;n otro compuesto que es&#180;te algo m&#225;s relacionado  con rocesos, por ejemplo, de conimicaci&#243;n celular, y aplicandocierto an&#225;lisis estad&#237;stico a las correlaciones de los colores? 

pudr&#237;a llevar a resultados interesantes a la pas de bonitos ,

</message>
    <name>socrafan</name>
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    <message>Para miembros de una misma especie la singularidad de los qualia (la rojez de lo rojo o lo doloroso del dolor, por ejemplo) debe ser un error despreciable, hablando de forma generalizada. 

A ver si pod&#233;is ampliar la informaci&#243;n sobre la Neuroanatom&#237;a Computacional. Parece muy interesante.

Saludos

J
os&#233;
M
anuel </message>
    <name>Jos&#233; Manuel</name>
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    <message>"Ideas. Provocaciones." Este comienzo, ciertamente estimulante, me ha animado a escribir la primera tonter&#237;a suelta que se me ocurre. Ah&#237; va:

Simplificando mucho: si la estructura de un cerebro queda descrita diciendo qu&#233; neuronas se conectan a qu&#233; neuronas, entonces  el n&#250;mero de cerebros posibles con 302 neuronas es de 2 elevado a 45451. No hay que desde&#241;ar la capacidad del c.elegans para encontrar un cerebro bueno entre tantas opciones, pero visto de otro modo, bastar&#237;an unos 45 kbits para describir la estructura de su cerebro. Tampoco parece mucho...

</message>
    <name>Jes&#250;s Cid.</name>
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    <message>Hola! 
Me ha interasado mucho la informaci&#243;n que da Vicky Puig sobre la neuroanatom&#237;a computacional :) podr&#237;as ampliarla un poco m&#225;s? no veo claro que ventajas podr&#237;a tener sobre el Brainbow. 
Merci </message>
    <name>Mar&#237;a</name>
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    <message>Mar&#237;a, 
Pues la ventaja principal es que todo est&#225; automatizado. El microscopio corta el cerebro y hace una fotograf&#237;a, el software lo lee inmediatamente y empieza la reconstrucci&#243;n. El software es muy sofisticado, utiliza un tipo de lenguaje llamado 'machine learning' (no s&#233; la traducci&#243;n al espa&#241;ol). B&#225;sicamente, el programador crea un software con unas reglas b&#225;sicas, pero con la gracia de que el programa puede 'aprender' de sus experiencias, y as&#237; refinar la interpretaci&#243;n de las im&#225;genes. Con este programa es muy f&#225;cil colorear cada neurona independientemente (al igual que hace Brainbow), pero es que adem&#225;s puedes hacer un sinfin de an&#225;lisis que con Brainbow llevar&#237;a a&#241;os. Por ejemplo, puedes medir el tama&#241;o de las neuronas, el di&#225;metro y la longitud de sus proyecciones, etc. de forma autom&#225;tica. Y adem&#225;s, en teor&#237;a, puedes reconstruir un cerebro entero (impensable hasta ahora para cerebros de mam&#237;fero). Repito que esta tecnolog&#237;a est&#225; en desarrollo.

Tradicionalmente, para hacer estas reconstrucciones haces una rodaja, procesas el tejido de varias formas y luego, una persona con mucha mucha paciencia utiliza un programa con el que 'dibuja' la neurona manualmente. Se ha hecho as&#237; durante d&#233;cadas. Como lleva muchos meses de trabajo, los grupos de investigaci&#243;n se centran en alguna parte peque&#241;a del cerebro. Es decir, la mayor&#237;a de trabajos de neuroanatom&#237;a hacen reconstrucciones de zonas concretas del cerebro, no de sus proyecciones a otras partes. 

Como los que hacen el software est&#225;n aqu&#237; en mi departamento voy a preguntar si tienen el video de las reconstrucciones colgado en alguna web. Es espectacular, de verdad.

vicky</message>
    <name>Vicky Puig</name>
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    <message>Vicky, si me permites una peque&#241;a correcci&#243;n, el Machine Learning, que puede traducirse como Aprendizaje de M&#225;quinas o Aprendizaje Estad&#237;stico, no es tanto un tipo de lenguaje como una disciplina cient&#237;fica que, simplificando, pretende proporcionar algoritmos para resolver problemas "aprendiendo" a partir de datos y ejemplos.

Precisamente en un congreso sobre Machine Learning asist&#237; el a&#241;o pasado a una conferencia de Sebastian Seung sobre el proyecto "Connectome" que supongo que es al que se refiere Vicky.

En la conferencia, contaba c&#243;mo estaban intentando elaborar el diagrama de conexiones de todas las neuronas de un cerebro a partir de im&#225;genes 3D de alta resoluci&#243;n de tejido cerebral. El problema, que b&#225;sicamente consiste en seguir el rastro de cada neurona, rodaja tras rodaja, de forma autom&#225;tica, es tecnol&#243;gicamente tan interesante como dif&#237;cil. Pero ver los grafos de conexiones de toda una red de neuronas era espectacular.

Si no recuerdo mal, el propio Seung hac&#237;a referencia a algunas cr&#237;ticas que cuestionaban la utilidad de un proyecto de este tipo. Desde luego, yo no s&#233; c&#243;mo puede utilizarse una descripci&#243;n puramente formal del grafo de conexiones neuronales para conocer mejor el cerebro, pero desde mi ignorancia me cuesta creer que no pueda sacarse alg&#250;n provecho de algo as&#237; alg&#250;n d&#237;a...


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    <message>Jesus,

gracias por la correcci&#243;n. Pues cient&#237;ficos como yo ser&#237;amos los que utilizar&#237;amos esta nueva tecnolog&#237;a. Nosotros investigamos como distintas zonas del cerebro se hablan entre ellas, ya sea a trav&#233;s de potenciales de acci&#243;n o de oscillaciones cerebrales. Est&#225; claro que la mayor parte de los conocimientos de anatom&#237;a cerebral provienen de estudios hechos en roedores (ratones y ratas). El cerebro de monos y humanos est&#225; mucho menos descrito, por ser los experimentos mucho m&#225;s complicados y caros. 

Yo le encuentro muchas utilidades a esta t&#233;cnica. Por ejemplo, para tener un conocimiento m&#225;s preciso de las proyecciones espec&#237;ficas de cada zona cerebral y saber qu&#233; zonas innervan a otras (y tambi&#233;n la densidad de estas proyecciones, para conocer qui&#233;n lidera el flujo de informaci&#243;n), hacer estimaciones de la variaci&#243;n anat&#243;mica entre sujeto y sujeto (ya sabemos que hay mucha variaci&#243;n, pero es importante determinar cu&#225;nta; se podr&#237;a utilizar para detectar malformaciones sutiles que conllevan a alguna enfermedad psiqui&#225;trica, por ejemplo). Adem&#225;s, el conocer el di&#225;metro y longitud de las proyecciones va a ser vital para hacer estimaciones m&#225;s precisas del tiempo que tarda una zona en comunicarse con otra (podr&#237;a ayudar enormemente a interpretar resultados obtenidos en los &#250;ltimos 50 a&#241;os), y, simplemente, para saber c&#243;mo de complejo es el cableado cerebral. 

Por otro lado, se supone que este software va a 'dibujar' el cableado con mucha m&#225;s precisi&#243;n de la que lo har&#237;a una persona manualmente. Por eso les est&#225; llevando tanto tiempo terminar el progama no? tienen que reducir el n&#250;mero de errores al m&#237;nimo (entendiendo 'error', por ejemplo, a seguir la dendrita de una neurona cuando en realidad est&#225;s siguiendo otra dendrita, parece que es bastante f&#225;cil cometer este tipo de errores). 

Si sabes m&#225;s sobre este proyecto por favor expl&#237;calo. Nosotros somos fisi&#243;logos y ellos matem&#225;ticos e inform&#225;ticos. Hacemos esfuerzos para comunicarnos pero es dif&#237;cil ;) </message>
    <name>Vicky Puig</name>
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    <message>Creo que deber&#237;as haber dejado m&#225;s claro la paradoja de Aquiles y la tortuga, pues est&#225; claro que la alcanza, s&#243;lo que tarda mucho, en realidad infinito tiempo.</message>
    <name>rafa</name>
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    <message>Saludos Pere, me encanta tu blog, lo descubr&#237; hace unas semanas y me lei de un tir&#243;n todos los art&#237;culos. La paradoja de Aquiles por algo parte como paradoja; como analog&#237;a podriamos poner que yo compito con Michel Jhonson en una carrera de 200 km y parto con una ventaja de 170 Km. Probablemente yo lleve ventaja casi toda la carrera, lo cual no quiere decir que yo sea m&#225;s rapido ni mas eficiente que el.
En realidad me met&#237; a tu blog esperando algo sobre la influenza porcina, ya que sigue sin convencerme nada de lo que oigo y veo. Vivo en M&#233;xico, la informaci&#243;n que se nos da es digna de formar parte de 1984 de Orwell. 
&#191;Por que tiene como blanco la poblaci&#243;n entre 20 y 45 a&#241;os? . &#191;Por que se argumenta que la mutaci&#243;n de este virus es c&#237;clica, cuando los antecedentes no muestran tal comportamiento?.
Si me atrevo a salir del tema es porque todos los temas que has tocado anteriormente me han hecho ver que vas mas alla de la metodolog&#237;a cient&#237;fica y te sumerges en la curiosidad innata del ser humano. </message>
    <name>Antonio</name>
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    <message>Vicky (Jes&#250;s),
para haceros una idea de lo que pueden dar de s&#237; los grafos de conexiones neuronales deber&#237;ais leer el libro de Redes Complejas de Ricard Sol&#233;. Es de la colecci&#243;n Metatemas de Tusquets. 
Con t&#233;cnicas de teor&#237;a de complejidad y con esos grafos se pueden sacar conclusiones asombrosas, no solo en este campo sino en todos aquellos en los que hay que contemplar el sistema que se estudia como un todo, que es lo que debe ocurrir con el cerebro: est&#225; tan interconectado en sus diferentes &#225;reas y es tan complejo en su din&#225;mica que estudiar sus partes independientemente puede llevar a conclusiones err&#243;neas.

Saludos a todos.</message>
    <name>guetto</name>
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    <message>Muy interesante art&#237;culo, como todos los de P&#232;re. Las utilidades de las GFPs (o s&#243;lo FPs) son incre&#237;bles, seguiremos alucinando con ellas. 

S&#243;lo una cr&#237;tica, por favor, C.elegans va con may&#250;scula (y cursiva). No escribir el g&#233;nero con may&#250;scula es, a mi entender, poco cient&#237;fico. 

Siento la cr&#237;tica, me encanta el blog. 

</message>
    <name>El talib&#225;n de la nomenclatura</name>
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    <message>Finalmente he conseguido el link al video sobre le proyecto Connectome, CON EL AUDIO EL EFECTO ES HOLLIWOODIENSE!

http://www.technologyreview.com/player/07/11/19Singer/1.aspx

Para explicaciones sobre el proyecto

http://www.technologyreview.com/biomedicine/19731/

Saludos</message>
    <name>Vicky Puig</name>
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    <message>Cualquier avance en la visi&#243;n neuronal es un avance cient&#237;fico, que tarde o temprano se traducir&#225; en un nuevo descubrimiento talvez revolucionario. El cerebro es un &#243;rgano que le falta mucho por estudiar. 

Saludos!</message>
    <name>Sebastian Huxley</name>
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    <message>Gracias, Vicky. Una vez m&#225;s, lo complicado es interpretar las im&#225;genes cient&#237;ficas. Las proyecciones espec&#237;ficas de cada zona cerebral y qui&#233;n lidera el flujo de informaci&#243;n: he ah&#237; el quid de la cuesti&#243;n.

Saludos, 

J
os&#233;
M
anuel</message>
    <name>Jos&#233; Manuel</name>
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    <message>Vicky Puig, Jes&#250;s Cid, guetto... este post de Pere ha logrado cosechar unos comentarios de un nivelazo sin precedentes, que yo recuerde. Pere debe estar flip&#225;ndolo, como yo. Mi aportaci&#243;n es menos t&#233;cnica, pero con respecto a aplicar estas t&#233;cnicas a la psicopatolog&#237;a... es algo parecido a pretender utilizar la f&#237;sica de part&#237;culas para comprender la qu&#237;mica org&#225;nica. Obviamente, todo est&#225; relacionado, pero el reduccionismo -tres hurras por el reduccionismo, por cierto- nos lleva siempre a una complejidad laber&#237;ntica que puede resultar poco &#250;til en la escala del comportamiento humano. En este sentido, creo mucho m&#225;s en la utilizaci&#243;n de neuroim&#225;genes con t&#233;cnicas de PET (Tomograf&#237;a de emisi&#243;n de positrones), que miden el metabolismo de la glucosa en diversas &#225;reas cerebrales, as&#237; como la  tomograf&#237;a computerizada de emisi&#243;n de fotones (SPECT) del flujo sangu&#237;neo cerebral relativo, en la l&#237;nea de los trabajos de Adrian Raine  o Robert D. Hare. Incluso Resonancia Magn&#233;tica Funcional.
Nos proporcionan escalas m&#225;s manejables, y en vez de segmentar el cerebro en neuronas, lo hacemos en regiones m&#225;s o menos definidas por una funci&#243;n especializada. Si lo que perseguimos es "cartografiar el pensamiento", entonces s&#237; creo en t&#233;cnicas como el Brainbow y las que hab&#233;is mencionado, que s&#243;lo logro entender de una forma vaga y muy abstracta. Saludos y gracias por vuestras estupendas aportaciones.</message>
    <name>I. Garc&#237;a-Vali&#241;o</name>
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